Decreto ejecutivo 1088 promulgado el 15 de mayo del 2008, por el presidente Rafael Correa, que en su artículo 1 señala lo siguiente: "Reorganízase el Consejo Nacional de Recursos Hídricos (CNRH) mediante la creación de la Secretaría Nacional del Agua, como una entidad de derecho público, adscrita a la presidencia de la república, con patrimonio y presupuesto propios, con independencia técnica, operativa, administrativa y financiera, y domicilio en la ciudad de Quito." En sus siguientes artículos el decreto especifica las políticas base para la gestión del agua así como las competencias, funciones y organización de la Secretaría del Agua como nueva entidad incorporada al sistema de gestión del agua en el país.